Mengisahkan dua orang remaja yang lahir dan hidup di tempat yang berbeda. Mitsuha adalah seorang gadis SMA yang tinggal di daerah pedesaan di pegunungan. Ayahnya yang jarang pulang ke rumah membuat Mitsuha hanya hidup bersama nenek dan adiknya yang masih SD. Mitsuha sering berkeinginan untuk pergi ke Tokyo karena bosan hidup di pedesaan. Sementara itu, Taki adalah seorang siswa SMA di kota Tokyo. Dalam kesehariannya, ia menghabiskan waktu untuk bermain dengan teman-temannya dan bekerja paruh waktu di restoran Italia. Dia juga tertarik dengan kesenian dan arsitektur. Suatu hari mereka mengalami pengalaman aneh di mana Mitsuha bermimpi dirinya menjadi seorang laki-laki. Dan sebaliknya, Taki bermimpi dirinya menjadi perempuan yang tinggal di daerah pegunungan yang tak pernah ia datangi.

Apa yang diperlukan untuk mewujudkan keinginannya? Setelah bulan Desember yang menguras tenaga, Sakuta dengan cepat mendekati akhir tahun keduanya di sekolah menengah. Karena Mai adalah siswa kelas tiga, mereka tidak memiliki banyak waktu bersama sebelum kelulusan tiba. Sementara itu, adiknya, Kaede, perlahan tapi pasti mulai berani keluar rumah lagi. Saat dia mulai menemukan pijakannya, dia mengumumkan tujuannya yang paling ambisius, yaitu masuk ke sekolah menengah atas kakaknya! Sakuta tahu lebih baik daripada siapa pun betapa sulitnya hal ini bagi Kaede, dan dia siap untuk mendukungnya sebisa mungkin. Dia hanya tidak yakin apakah itu yang terbaik untuknya… atau apa yang sebenarnya dia inginkan…